Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms