Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
CD164Q04900 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
CD164Q04900 UBA52-202ENST00000442744 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
CD164Q04900 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
CD164Q04900 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
CD164Q04900 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
CD164Q04900 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
CD164Q04900 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
CD164Q04900 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
CD164Q04900 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
CD164Q04900 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
CD164Q04900 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
CD164Q04900 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
CD164Q04900 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
CD164Q04900 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
CD164Q04900 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
CD164Q04900 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
CD164Q04900 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
CD164Q04900 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
CD164Q04900 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
CD164Q04900 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
CD164Q04900 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
CD164Q04900 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
CD164Q04900 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
CD164Q04900 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms