Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF85Q03923 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms