Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 RN7SL363P-201ENST00000482412 273 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 PLA2G4C-AS1-203ENST00000601950 454 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC6Q03468 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms