Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPCQ03188 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms