Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms