Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms