Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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H3F3AP84243 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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H3F3AP84243 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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H3F3AP84243 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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H3F3AP84243 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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H3F3AP84243 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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H3F3AP84243 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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H3F3AP84243 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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H3F3AP84243 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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H3F3AP84243 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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H3F3AP84243 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H3F3AP84243 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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