Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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