Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms