Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF10P55107 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF10P55107 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF10P55107 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF10P55107 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF10P55107 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF10P55107 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF10P55107 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF10P55107 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF10P55107 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF10P55107 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF10P55107 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF10P55107 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF10P55107 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF10P55107 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF10P55107 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF10P55107 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF10P55107 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF10P55107 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF10P55107 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF10P55107 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF10P55107 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF10P55107 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF10P55107 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF10P55107 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF10P55107 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF10P55107 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDF10P55107 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDF10P55107 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF10P55107 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms