Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms