Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP4P49662 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASP4P49662 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CASP4P49662 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CASP4P49662 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP4P49662 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms