Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA3P32297 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms