Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFNP31947 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFNP31947 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFNP31947 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFNP31947 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFNP31947 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFNP31947 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms