Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms