Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms