Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms