Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms