Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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PTPRBP23467 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PTPRBP23467 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PTPRBP23467 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PTPRBP23467 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PTPRBP23467 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PTPRBP23467 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PTPRBP23467 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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PTPRBP23467 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PTPRBP23467 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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