Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTGS1P23219 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms