Protein–RNA interactions for Protein: P20849

COL9A1, Collagen alpha-1(IX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A1P20849 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 AL390039.1-201ENST00000399148 611 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 GAPDHP74-202ENST00000632456 782 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms