Protein–RNA interactions for Protein: P19878

NCF2, Neutrophil cytosol factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF2P19878 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NCF2P19878 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NCF2P19878 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NCF2P19878 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NCF2P19878 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NCF2P19878 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NCF2P19878 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NCF2P19878 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NCF2P19878 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NCF2P19878 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF2P19878 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF2P19878 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF2P19878 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF2P19878 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF2P19878 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF2P19878 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF2P19878 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF2P19878 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF2P19878 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF2P19878 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF2P19878 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF2P19878 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF2P19878 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF2P19878 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF2P19878 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF2P19878 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF2P19878 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF2P19878 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF2P19878 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF2P19878 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF2P19878 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF2P19878 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF2P19878 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF2P19878 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF2P19878 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF2P19878 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF2P19878 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF2P19878 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF2P19878 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF2P19878 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF2P19878 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NCF2P19878 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms