Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EGR1P18146 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EGR1P18146 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EGR1P18146 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EGR1P18146 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EGR1P18146 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
EGR1P18146 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
EGR1P18146 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
EGR1P18146 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EGR1P18146 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EGR1P18146 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
EGR1P18146 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EGR1P18146 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EGR1P18146 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EGR1P18146 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EGR1P18146 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EGR1P18146 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EGR1P18146 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EGR1P18146 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EGR1P18146 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EGR1P18146 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EGR1P18146 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EGR1P18146 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EGR1P18146 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EGR1P18146 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EGR1P18146 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EGR1P18146 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
EGR1P18146 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EGR1P18146 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EGR1P18146 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EGR1P18146 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EGR1P18146 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EGR1P18146 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EGR1P18146 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EGR1P18146 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EGR1P18146 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EGR1P18146 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EGR1P18146 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EGR1P18146 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EGR1P18146 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EGR1P18146 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EGR1P18146 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EGR1P18146 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EGR1P18146 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms