Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCNAP12004 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCNAP12004 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCNAP12004 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCNAP12004 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCNAP12004 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCNAP12004 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCNAP12004 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCNAP12004 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCNAP12004 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCNAP12004 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCNAP12004 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCNAP12004 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCNAP12004 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCNAP12004 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNAP12004 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNAP12004 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNAP12004 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNAP12004 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNAP12004 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNAP12004 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNAP12004 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNAP12004 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNAP12004 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNAP12004 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNAP12004 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNAP12004 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNAP12004 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNAP12004 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNAP12004 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNAP12004 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNAP12004 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNAP12004 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNAP12004 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNAP12004 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNAP12004 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNAP12004 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNAP12004 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNAP12004 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNAP12004 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNAP12004 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNAP12004 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNAP12004 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCNAP12004 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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PCNAP12004 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PCNAP12004 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PCNAP12004 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCNAP12004 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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