Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ESRRAP11474 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ESRRAP11474 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ESRRAP11474 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ESRRAP11474 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ESRRAP11474 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ESRRAP11474 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ESRRAP11474 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ESRRAP11474 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ESRRAP11474 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ESRRAP11474 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ESRRAP11474 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ESRRAP11474 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ESRRAP11474 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ESRRAP11474 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ESRRAP11474 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms