Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
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