Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALB1P05937 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALB1P05937 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALB1P05937 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALB1P05937 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALB1P05937 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALB1P05937 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALB1P05937 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALB1P05937 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALB1P05937 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALB1P05937 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALB1P05937 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALB1P05937 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALB1P05937 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALB1P05937 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALB1P05937 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALB1P05937 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALB1P05937 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALB1P05937 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALB1P05937 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALB1P05937 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALB1P05937 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALB1P05937 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CALB1P05937 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALB1P05937 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB1P05937 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB1P05937 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB1P05937 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB1P05937 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB1P05937 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB1P05937 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB1P05937 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB1P05937 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB1P05937 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB1P05937 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB1P05937 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB1P05937 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB1P05937 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB1P05937 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB1P05937 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB1P05937 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB1P05937 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB1P05937 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB1P05937 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB1P05937 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB1P05937 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB1P05937 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB1P05937 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB1P05937 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB1P05937 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB1P05937 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB1P05937 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALB1P05937 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms