Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
F9P00740 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
F9P00740 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
F9P00740 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
F9P00740 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
F9P00740 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
F9P00740 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
F9P00740 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
F9P00740 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
F9P00740 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
F9P00740 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
F9P00740 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
F9P00740 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
F9P00740 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
F9P00740 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F9P00740 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
F9P00740 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
F9P00740 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
F9P00740 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
F9P00740 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
F9P00740 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
F9P00740 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms