Protein–RNA interactions for Protein: O75167

PHACTR2, Phosphatase and actin regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR2O75167 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR2O75167 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR2O75167 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR2O75167 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR2O75167 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR2O75167 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR2O75167 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR2O75167 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR2O75167 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR2O75167 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR2O75167 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR2O75167 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR2O75167 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR2O75167 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR2O75167 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR2O75167 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR2O75167 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR2O75167 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR2O75167 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR2O75167 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR2O75167 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR2O75167 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR2O75167 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR2O75167 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR2O75167 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR2O75167 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR2O75167 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR2O75167 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR2O75167 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR2O75167 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR2O75167 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR2O75167 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR2O75167 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR2O75167 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR2O75167 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms