Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MTSS1O43312 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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