Protein–RNA interactions for Protein: O15540

FABP7, Fatty acid-binding protein, brain, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FABP7O15540 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FABP7O15540 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FABP7O15540 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms