Protein–RNA interactions for Protein: O15315

RAD51B, DNA repair protein RAD51 homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51BO15315 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD51BO15315 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms