Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRPO00591 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
GABRPO00591 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
GABRPO00591 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
GABRPO00591 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
GABRPO00591 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRPO00591 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms