Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms