Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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RAB23Q9ULC3 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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RAB23Q9ULC3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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RAB23Q9ULC3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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