Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms