Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms