Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHPF2Q9P2E5 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms