Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MMP26Q9NRE1 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms