Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM8Q9BZR9 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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