Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIFKQ9BYG3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms