Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms