Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LYSTQ99698 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms