Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKP4Q99569 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms