Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms