Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCNAQ96QF7 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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