Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIC2Q96JB3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms