Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms