Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A3Q93084 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms